Назад в будущее

Назад в будущее : размер 500x280, 47.23 kb

Взгляните на наше будущее. Что видите? Наверное, именно так люди 40 лет назад смотрели на микропроцессор Intel 4004, не понимая, к чему приведет его появление. Маленькая микросхема за 200 долларов заменила собой огромные ЭВМ и теперь персональный компьютер стоит на столе почти у каждого, а то и помещается в кармане.
На фото — микрочип для уже не раз тут упомянутой системы полногеномного секвенирования Ion Torrent. До ее появления десяток лет назад оборудование для сравнимой производительности занимало целые здания, несколько лет назад — комнаты, а теперь помещается на столе. Это первый в мире секвенатор, не использующий дорогостоящие реагенты и сложные оптические преобразования — реакция происходит в микролунках чипа, изготовленного по полупроводниковой технологии, как и первые микросхемы. Все это позволяет кардинально упростить и удешевить процесс секвенирования.
Уже получены первые результаты практического применения — за два дня создана тест–система для обнаружения патогенной палочки, вызвавшей эпидемию в Европе, больницы используют этот секвенатор для определения больничных инфекций и многого другого, но все это мелочи.
Настоящий потенциал системы может показать только секвенирование генома человека. И наконец, через год после появления Ion Torrent, это произошло.
Наверное, справедливо, что первым человеком, который получил свой геном, отсеквенированный по полупроводниковой технологии, стал отец этой самой технологии — Генри Мур. Поразительно, что его детище получает второе рождение на новом витке инженерной эволюции, на этот раз биологическом. А дар предвидения оказался настолько велик, что знаменитый закон Мура распространяется теперь не только на микросхемы, но и на новую технологию — с каждым годом стоимость секвенирования все снижается, аппараты становятся все проще и закончится это все, как и с компьютерами, появлением персональных геномных анализаторов у нас на столе. Ждать осталось недолго.
 в фейсбук
 в твиттер
вы смотрите все комментарии
…Он устало прикрыл воспаленные веки и задернул тяжелую портьеру. За ней было не окно, а огромный экран, освещающий бетонную коробку призрачным мерцанием бесконечного белого шума. В полной темноте мысли не казались столь беспросветными, а стены не так давили. И как всякий лишенный общения, чтобы не окончательно тронуться умом, он говорил сам с собой. Отрывистые, хриплые фразы повисали в сухом воздухе Убежища.
— Когда это случилось? Дай–ка вспомню… 2020–й или 2025… "Познай самого себя?"… Генный анализатор в мобильном телефоне… "Старости и смерти — конец", писали тогда в Нью–Йорк Блог… Благие, благие намерения.

Он замолчал и задумался.
— Никто и не вспомнит, кто был первым. А дальше всё по этой же дороге. Гены геены огненной. Мода на цвет глаз и кожи. Новые оттенки. "Эволюционируй за ночь!" Что они выращивали из головы вместо волос? Перья? Чешую? А после четвертого взрыва на Фукусиме и теракта в Бушере…

Он снова надолго ушел в себя.
— Кто первый начал войну? Пуристы или мутанты? Неважно. Победителей нет. Есть проигравший. Род человеческий. Мне 126 или 127 лет. Я последний.

И набрав полную грудь затхлого воздуха, он страшно, протяжно закричал. — Будь! Прокляты! Секвенаторы!!
Postoronnim_V: …Он устало прикрыл воспаленные веки и свернул окно браузера. Крохотную комнатку освещал экран. Криво пришлепнутая на нем наклейка гласила: "Роснано". Из–под нее выглядывал логотип acer.
Он говорил сам с собой и этого общения ему обычно хватало.
— Вся главная в сообщениях о наших успехах. Мы запустили, одержали, модернизировали, оставили за спиной. Черт бы всех побрал.
Замолчал. Вспомнил свой последний выход на улицу. То что там происходило, в новостях на главной не увидишь. — Асимптотически… — прошептал он.
— Когда же это началось? Теперь неважно.
Он выделил в адресной строке http ://dirty.ru, ввел http: //www.1tv.ru. Закричал, в начале грозно в конце дав петуха:
— Будь! Прокляты! Золотые посты о секвенаторах! — И нажал ввод.
Ногти очень хорошо выглядят, что редко бывает на технических фотографиях.

размер 500x280, 107.02 kb

pdp: это технические ногти будущего.
phenom: генетически улучшенные.
russellcrow: сепулькированные?
Akula:
Avialn, женитесь на мне! Я уже устала читать ваши посты с упоением, лучше рассказывайте мне их по вечерам у камина! А я буду носить платья из ваших рубашек )
Wanna_dance: Я думаю, все будут со мной солидарны — с такими комментариями надо постить сиськи!
Wanna_dance: Гены в начале свои предъявите. Во избежание, так сказать.
Dizza: гмм. дама может задеть не менее каверзный вопрос о мутаторе. чёрт, по моему я не туда пишу…
Dizza: не путать с гениталиями. Это важно.
Wanna_dance: Что–то мне подсказывает, что, в силу пятничных настроений, после этого коммента никто про секвенатор уже и не вспомнит.

Чтобы не показаться задротом, добавлю, что на сиськи я бы тоже взглянул.
Wanna_dance: Какой неожиданный поворот сюжета :)
avialn: Дружище, я тебе вот что скажу. НЕ ТУПИИИИ!!!!!! :)
Wanna_dance: ого! на месте Avialn я бы не оставил без внимания этот коментарий :)
derbeobachter: Служебный роман.
Genki: ничего в этом нет предосудительного :)
…геномных анализаторов у нас на столе. Ждать осталось недолго.
Да что там на столе — школьники будут тыкать мобилами друг в друга и восхищаться: "ты мой брат на 0,0758%!"
russellcrow: ну или ты "Эй ты пацак, это чатланская школа."
gar2k: pdp: Вопрос "Ты с какого раёна?" тоже будет иначе звучать.
russellcrow: "теперь ты мой брат на 0,215%!"
Ничего не понял. Что такое полногеномное секвенирование? Хоть бы ссылок побольше что ли…А теперь вот в гугл лезть. В пятницу! Авиалн — ты желаешь мне зла…
malster: Ну логично, что это секвенирование геномов?
avialn: а сепульки предназначены для сепулькарения.
derbeobachter: Лем зараза. До сих пор мучает этот вопрос.
malster: Не важно что это, главное что это волнительно и обнадеживающе! В пятницу, когда на горизонте виднеется только субботнее похмелье, посты о радужном будещем как глоток свежего воздуха! (я тоже не понял)
malster: это такие сепульки
malster: А что, в пятницу в гугле пробки?

размер 499x330, 94.49 kb

Потом придумают дистанционный вариант и получится "Визатор".

image

Как и было предсказано, о теме поста все забыли…
avialn:

размер 500x280, 29.81 kb

Wanna_dance:

размер 500x280, 56.28 kb

Akula: блин, опередили… я тоже тут старалась! хотела написать, что вообще весь этот пост и главное картинка — лишь пятничное манипулирование сознанием

размер 500x280, 31.51 kb

Wanna_dance: Сложная фотография. В ней можно многое увидеть.
Wanna_dance: мне нравится этот манипулятор сознанием :)
Wanna_dance: А Вы, кстати, как к полигамии относитесь?
casualman: Не решался спросить…
avialn: а Вы вообще такой нерешительный .)
Wanna_dance: И как только женился :)))
avialn: рад был помочь, если чо
casualman: как отношусь? больше одного мужа..хм, ну даже не знаю.. завидовать начнут
Wanna_dance: пора заводить инбокс шведских семей
Wanna_dance: какой прекрасный ответ. очень элегантная шпилька :)))
Wanna_dance: Не в том направлении мыслите, не в том.
Зачем это нужно людям, далеким от биологии и генетики?
Yanis: А зачем нужны были компьютеры людям, далеким от программирования.
Yanis: В бытовом смысле, если очень коротко, это нужно для того, чтобы назначать вам персонифицированное лечение. Геном — это чертеж вашего организма. Когда инженер (врач) имеет на руках чертеж, он может очень быстро найти неисправность. Но когда чертежа нет, он долго ищет неисправность по косвенным явлениям (симптомам).
hardie: ну это если заболевание генетическое. А простуду по геному не вычислить, насколько я могу судить.
KoT_XydozhniKa: Простуду и не надо. А вот выявить склонность человека к простуде и обнаружить его врожденные проблемы с иммунной системой — вполне перспективные задачи.
KoT_XydozhniKa: а если заболевание в слабой форме и его не видно? А потом у вас рождается ребёнок с более тяжёлой формой такого же, а вы даже не могли предположить
iskorka: если генетическое, то будет видно, даже если вы только носитель. А если приобретенное, то не поможет. Поможет так же, если у вас есть какие–то генетические противопоказания к некоторым лекарствам, только я далеко не медик, чтобы рассуждать на такие темы, могу лишь фантазировать
KoT_XydozhniKa: расскажите это родителям, которые родили деток с муковисцедозом, например. Про то, что "и так видно"
iskorka: вы читать комментарии не умеете или вам обязательно нужно вступить в конфронтацию? Не "и так будет видно" а " то будет видно (в геноме), даже если вы только носитель".
Yanis: ахахаха, вот и я о том же выше написал))
Господа! Сейчас мы проверим сказки о мужской дружбе и солидарности: уговорите avialn для начала дать мне свою рубашку, я вам продемонстрирую платьица, а уж если после этого вы его даже уговорите, чтобы я продемонстрировала вам, толпе смятенной, свои прелести, то что ж.. куда деваться — желание будущего мужа — закон! Поехали )
Wanna_dance: Засада, у меня нет рубашек :(((
avialn: будь мужчиной! срочно купи рубашку! на твоём месте я бы сейчас в интернет магазине выбирал приятную расцветку. я серьёзно. А ещё лучше быстро сбегать и купить. Только купи хорошую рубашку, даме будет более приятнее :)
derbeobachter: Рекомендую белую, пригодится на свадьбу
casualman: я желаю чтобы все присутствующие были на нашем празднике! *топ ножкой*
Wanna_dance: это официальное приглашение?
casualman: официальное будет на главной, зашифрованное под очередной пост из новинок био–нано–технологий от avialn вот так, один из самых интереснов авторов перестал писать на d3
casualman: к чему эти стереотипы? приятный розовый смотрится восхитительно. И сочетается с тёмным костюмом.
derbeobachter: белая рубашка — это классика. Благородная, надежная, проверенная схема.
casualman: я вот сейчас озадачен приобретением банального зонтика. И благородная надёжная схема в виде "радикально чёрного цвета" у меня вызывает уныние. Хочется чего то чуть ярче и светлее.

Впрочем рубашек как и зонтов желательно несколько :)
avialn: к моему сожалению, у меня тоже (( у вас какой рост? может мне ваши футболка как платья будут. вы вообще в принципе одежду то носите? ))
Wanna_dance: У него штаны подходящие для вас )

размер 341x398, 25.35 kb

Akula: откуда у нее мои джинсы?
Wanna_dance: В принципе ношу. Иногда :)
Футболки не то…
Хотя по такому случаю пора обзавестить и рубашкой.
avialn: три, как минимум три рубашки. для начала и одна хороша. только не бери в полосочку как в том посте. нам на фото рябить будет. "интеллектуальная клетка" в самый раз. как у Локера из "Обмани меня" (Теория лжи)
avialn:
…Дед Мороз разочарованно разводит руками и говорит:
— Ну твою ж мать! © Анекдот.
avialn:??? Платьица, юбочки… ))
Wanna_dance: А вот и первая интрига: alderina, видимо, тайно влюблена в avialn, но боится признаться. Wanna_dance, будьте осторожнее.
Rommor: ну так какой мужчина, какой мужчина!
Вот так и тянет спросить, а зачем это обычному человеку..но наверно так было с большинством открытый..
NikulinS: Гаттака.
avialn: Так это будет покруче атомной бомбы. Этот прибор стремительно приближает нас к обществу всеобщего неравенства, причём без возможности что–либо исправить.
ticon: Это природа, куда от нее денешься.
ticon: Типа до этого было общество всеобщего равенства.
sompson: Нет, конечно, просто теперь от тебя вообще ничего не зависит. Извини, ничего личного: "Это природа, куда от нее денешься." Вэлкам ту газенваген, ну или в будку самоубийств, кому как больше нравится.

Безусловно, этот девайс открывает огромные перспективы для человечества, но это как с той же ядрёной бомбой — смотря в каких руках окажется.
Вот везет же некоторым: и пост золотой, и девушки замуж просятся сами…
casualman: На его месте должен быть я! :))))
derbeobachter: зависть — плохое чувство, %username%
casualman: :) даже белая? :)
casualman: Ну золото фигня, а вот ради таких девушек стоило сюда попасть :))
avialn: И вообще, теперь у меня есть муза.
avialn: м? ) пишите ещё! буду читать и музицировать.. издалека, с томным взглядом неразделённой любви )
Wanna_dance: Теперь в существовании моих постов появится смысл. Это прекрасно :)
avialn: ну не скромничайте и не обижайте наших со–юзеров, которые любят ваши посты не меньше моего (оглянитесь вокруг — Вы же купаетесь в золоте.)) Просто не все выражают своё признание так открыто ))
Wanna_dance: Золото есть, а смысла нет. Даже пригласить некого :(
casualman: Не настолько везет, как кажется, вопрос с текущей женой почему–то сам не рассасывается :)))
avialn: женат и нет рубашек?? )
Wanna_dance: Так точно :(
Так что шанс всегда есть :)))
Wanna_dance: avialn: ого, интрига только начинается )))
письмо Кашпировскому: "Спасибо Вам, доктор! После Вашего сеанса у меня рассосалась жена…"
avialn: делов–то — ислам принять…
casualman: Браво! Элегантное решение! :)
derbeobachter: Осталось уговорить вторые половины. И настоящую, и будущую :)
avialn: А там не спрашивают. Есть такой древний обычай..
avialn: ну вот, зачем ты сразу разбил всю интригу??? :)
derbeobachter: А кому–то так даже интереснее.
Собственно, вдруг кто забыл, закон Мура (от 1965 года) говорит о тем, что количество транзисторов на кристалле микропроцессоров удваивается каждые два года (красивая картинка из вики). А теперь вспоминаем пророчество Хокинга: "В отличие от нашего интеллекта, производительность компьютеров удваивается каждые 18 месяцев, — сказал Хокинг, сославшись на закон Мура. — Опасность, что у них возникнет интеллект, и они покорят мир, вполне реальна".
ПОКАЙТЕСЬ!! Ибо грядет!!!
KoT_XydozhniKa: кому покаяться? Своему лэптопу?
mike75:

image

KoT_XydozhniKa:

10 SIN
20 GOTO HELL
О времена, о нравы: просишь мужчину публично жениться на тебе, а толпа требует плоти! ))
Wanna_dance: мы переживаем за пользователя avialn. За такое количество отличных постов ему должны достаться хорошие си.. хорошая девушка!
radiolog: главное — душа!
KoT_XydozhniKa: Конечно, душа. Но сиськи тоже.

У вас, наверное, тоже в детстве спрашивали глупые взрослые "А ты кого больше любишь, маму или папу?"
не, у мне родители умные, таких идиотских вопросов не задавали — и так было понятно, что за все телесные наказания отвечал папа, но он никогда не сердится, и исполнял все экзекуции с позиции палача; с другой стороны, он знал всё на свете и я им очень гордился в детстве, да и сейчас горжусь. Красным кардиналом всегда была мама, но она покупала мороженное. Вот в таком когнитивном диссонансе и прошло моё детство.
*"серый кардинал" и "мороженое", конечно же.
Wanna_dance: Черт, я настолько привык к весьма специфическим дискуссиям на этом ресурсе, что совершенно забыл о существовании здесь прекрасного пола. Я растерян.
avialn: Женись! Девушка–то хорошая, сиси от нас скрывает, для тебя бережёт. А вдруг это судьба?…
avialn: ещё раз повторюсь :) не тупи :)
derbeobachter: Подождите все, у меня шаблон ломается.
avialn: к чёрту шаблон! ломай его быстрее. открой себя для новых ощущений! :)
Wanna_dance: зрелищ! толпа требует зрелищ. :) в рубашечках как в том посте :)
Я всё–таки напишу по теме поста, можно?

Да, он маленький, дешёвый (как сам прибор, так и эксперименты), быстрый и простой, уход от флуоресцентной химии в полупроводники можно только приветствовать (реактивы крайне быстро тухнут, лазеры и камеры слишком часто ломаются). Но производительность у него маловата. Для полногеномного секвенирования в нынешнем значении этого слова (30–кратное покрытие генома человека, т.е. примерно 90 гигабаз; Мура сняли с 10–кратным покрытием, это годится разве что для удовлетворения любопытства) его надо запускать слишком много раз, это в конечном счёте выходит дороже и дольше полноценных nextgen секвенаторов (стоимость проекта по геному Мура оценили в $2 млн., сейчас он будет стоить не менее $200 тыс.; относительно дорогой «русский геном» при втрое большем покрытии обошёлся максимум в те же двести тысяч, только два года назад). Сфера его применения — чтение отдельных генов или секвенирование бактерий.
Также у него пока имеются некоторые «детские проблемы» с определением делеций и инсерций, но это наверняка скоро починят (в отличие от производительности, которая, конечно, будет расти, но незначительно, дабы не откусывать рынок у старших собратьев).
ninch: Все только начинается. Чипы уже есть в десять раз более производительные, да и другие технологии не стоят на месте.
Вот про искусственное ограничение производительности — это да, но это уже вопросы маркетинга в нашем сложном мире, их касаться не хотелось бы.
avialn: Тут ещё такая штука, что данные, получаемые с Ion torrent сейчас, можно обсчитать и хранить на обычном современном мощном десктопе (может даже входящем в комплект поставки), любая лаборатория может себе это позволить (если уж наскребла на инструмент). В десять раз больше, подбираясь к 454, иллюминам и солидам — это уже надо обзаводиться полноценным сервером и биоинформатиками, уже нетривиально с точки зрения денег и кадров. Я к тому, что ниша таргетного секвенирования сама себя ограничивает и вполне самодостаточна, так что это не только маркетинг.
ninch: Ну так теперь и появился смысл дальнейшего наращивания мощностей. Это сейчас с объемами справляются только мощные сервера, а через 20 лет обычный телефон будет мощнее.

image

Вы тут все секвенируете, а там пацаны нашли планету, состоящую целиком алмаза. Может, махнем туда?
KoT_XydozhniKa: Что там на ней делать, её даже не покопаешь, лопата сломается.
ninch: прилепим к ней маленькое колечко и будет уже перстенек. в ломбард там, или цыганам
ninch: главное — застолбить. А в пути придумаем как с ней управиться.
ninch: Можно тюкнуть аккуратно на мелкие кусочки.
Это ж надо так было накосячить С Муром. Он же Гордон!!!
Тьфу.
avialn: "Сам ты гордон!" — подумал Генри.
testas: Майкл Мур и Гарри Мур несогласны
Рубашки шелковые размеров XL — XXXXXL. Недорого. +7–495–ххх–хх–хх.
Лююююди. А скажите, первые 40 секунд вот этого ролика на первом(!!!) канале — это вообще нормально?
avialn: нет, конечно. Это бред полный.
casualman: Это я понимаю, что бред, но такое на первом? Куда катится мир. Отстал я от жизни, видать.
avialn: фосфаты у них, блядь, светятся… это полный пиздец.
casualman: Выйдешь, бывало, ночью в поле — а оно светится всё, потому что удобряли суперфосфатами. (нынешняя молодежь хоть слово такое знает?)
casualman: извините, не сдержался.
И да, они наверное путают фосфоресценцию с опалесценцией.
avialn: На первом нормально.
next gen sequencing — это очень круто.

размер 500x254, 31.00 kb

Не хочу никого обидеть и снижать градус пафоса поста, но закон Мура уже года два как мёртв, число транзисторов на кристалле не удваиваться каждые 24 месяца.
ELNIK:
>> закон Мура уже года два как мёртв
Давайте что ли доказательства, а то вы тут с пафосом хороните законы. К тому же два года — не показатель, как и любые экспериментальные данные, даты имеют некую дисперсию (см. картинку). Строго про 24 месяца опять же никто не говорил, даты варьируются в пределах 18–24 месяца с погрешностью.
KoT_XydozhniKa: строго говоря, "закон Мура" — это никакой не закон, а эмпирически выявленная зависимость. Законом её делает исключительно маркетинговая политика корпорации Intel. Кроме этого, не существует никаких объективных причин, почему закон Мура вообще должен соблюдаться.
hardie: Закон, справедливость которого была установлена не из теоретических соображений, а из опытных данных, называют эмпирическим законом.
С отсутствием объективных причин согласен.
KoT_XydozhniKa: Гугл то у вас есть? Там куча материала на эту тему. Про интел тоже правда, одной из причин почему они они перешли на увеличение количества ядер на процессорах именно этот самый неработающий закон Мура.
ELNIK: гугл есть, только что проверил. Все что встречал о нарушении этого закона — пока только амбициозные планы. Про интелловские ядра ничего не знаю, свечку не держал (только не понимаю, зачем им сдерживать собственные темпы развития). И вообще, спор этот пустой, ибо никакого смысла в нем нет — выйдут за рамки этого закона — да и бог с ними, придумают новый закон ради "красного слова".
ELNIK: Да его не надо абсолютно воспринимать. Он и для цены полногеномного секвенирования не выполняется строго — ее снижение обгоняет прогнозы.
Смысл в тенденции, а не в числах.
ELNIK: Но сам то Мур… Нет, нет, молчите, я не хочу ничего знать.
Все это здорово, но я пока не совсем пойму зачем секвенатировать дома геном человека.
В то время как зачем мне дома intel 4004 я предположить могу.
Shir_man: вы как хотите, а я хочу разрабатывать в домашних условиях фосфоресцирующие голубые розы и восьмилапых хомячков.
Garkin: А светящуюся елку?
Garkin:

И четырехжопую обезьяну.

размер 349x204, 12.49 kb

Shir_man: В то время как зачем мне дома intel 4004 я предположить могу.
А если перенестись на сорок лет назад?
Iaon: калькулятор. Простейшая функция компьютера. И в быту применяется всеми.
Shir_man: (гость из будущего mode on) Хм. А вот если у вас насморк вдруг — как вы лечитесь? А как проверяете прибывшие по линии доставки ГМ–помидоры на отсутствие ваших персональных аллергенов?
Shir_man: Чтобы потом убить жену, детей, и выпрыгнуть из окна двенадцатого этажа с бутылкой водки. Вредная штука этот секвенатор.
При таких успехах уже наше поколение испытает на себе избирательное биологическое оружие.
Весьма оптимистичный пост (как и статья в "Природе"). Пока это устройство выглядит гораздо сложнее старорежимных сиквенаторов. Там, по крайней мере, надо просто флюорецентных терминаторов насыпать в реакцию, а не организовывать постоянную смену нуклеотидов. Есть и другие сложности.
immutatus: проще сангеровских секвенаторов сложно что–либо придумать, только они дорогие и читают помалу и без покрытия (хотя и ошибок меньше); ну да опять же — у них своя ниша.
Ion Torrent проще некстгенов и это уже большой прорыв. Более того, в российских реалиях он любому другому секвенатору даст сто очков вперёд из чисто хозяйственных соображений, потому что ломающихся дорогих деталей меньше, а чипов можно закупить хоть на десять лет вперед. Некоторые флуоресцентные реактивы иногда тухнут к моменту поставки сюда из штатов, такие тут задержки.
immutatus: К тому же это устройство одноразовое.
city–rat: Это чип одноразовый, а не устройство. Да и то, не факт :)
Чему там портиться.
avialn: "устройство" и "изделие" — слова универсальные. Данное изделие немного того — загрязняется.
Генная пятница на дирти. Одной wanndance не справится.
Хороший пост, да и про закон Мура я до этого не знал) Спасибо.
Дети — наше будущее, а не железячки.
puru–shin: Именно им все это и предстоит увидеть.
Одно только помещение слова Torrent на чип чего стоило интернет–сообществу…
Ion Torrent mojet sekventirovali 60–100 genomov.
Complete Genomics(shameless plug, I work there) uje sekventirovali bolshe 6000.
Budushee za genomami, no ne za Ion Torrent.
phila: Однако… На всякий случай намекну: здесь не принято так писать.
и это прекрасно!

image